ProxAI accélère la découverte de médicaments pour les cibles difficiles à atteindre en concevant des modulateurs protéiques sur mesure qui inhibent des interactions protéine-protéine clés ou induisent la dégradation. Le tout validé en cellules.
Les programmes sur cibles difficiles butent généralement sur l’un de quatre murs. Trouvez le vôtre ci-dessous, puis voyez comment nous le franchissons.
Le génome humain code plus de 600 ligases E3, pourtant la plupart des dégradeurs recrutent CRBN ou VHL. Les deux sont exprimées dans presque tous les tissus : la dégradation se produit donc dans tout l’organisme, effets indésirables compris.
Comment nous le franchissons Nous concevons des liants pour la ligase E3 de votre choix : nouvelle, exclusive ou restreinte au tissu que vous visez.
Le kinome humain compte 518 membres, la plupart bâtis autour de la même poche à ATP conservée. Un ligand conçu pour l’un touche souvent ses parents, ce qui brouille vos données et réduit la marge d’innocuité.
Comment nous le franchissons Nous concevons des liants contre les caractéristiques de surface qui distinguent votre cible de ses parents, et non contre la poche qu’ils partagent.
Les interfaces protéine-protéine couvrent généralement 1500 à 3000 Ų de surface essentiellement plane. Une petite molécule en couvre de 300 à 1000 Ų et doit s’ancrer dans une poche. Beaucoup de moteurs de maladie n’en offrent aucune.
Comment nous le franchissons Nous construisons des liants qui recouvrent l’interface elle-même et la bloquent stériquement. Aucune poche requise.
Votre cible compte cinq domaines fonctionnels et vous devez en étudier un seul. Une invalidation les élimine tous les cinq : impossible de savoir quelle perte a causé le phénotype.
Comment nous le franchissons Nous bloquons la surface d’un seul domaine. La protéine reste intacte et ses quatre autres fonctions continuent de fonctionner.
Conçu contre la surface exacte que vous choisissez, puis validé dans des cellules physiologiquement pertinentes avant de vous parvenir.
Apportez-la à un appel de cadrage de 30 minutes. Nous vous dirons à quel mur elle se heurte et si un liant protéique est la bonne façon de le franchir.
Évaluation gratuite de votre cibleVous préférez écrire ? Envoyez-nous plutôt votre cible.
Deux voies, une seule plateforme d’ingénierie. Les deux sont conçues à partir de la structure et validées en cellules avant de vous parvenir. C’est votre cible qui détermine la voie qu’il vous faut.
Nous concevons une protéine qui se lie à la surface de domaine exacte que vous désignez, puis s’y installe. La protéine partenaire ne peut plus atteindre l’interface : une fonction se tait, les autres demeurent. Aucune poche requise.
La même protéine de reconnaissance de la cible est reliée par un segment de liaison à un liant de ligase E3. La construction amène la ligase jusqu’à votre cible, la cible est ubiquitinée et le protéasome élimine la protéine entière. Vous choisissez quelle ligase E3 fait le travail.
Engagement de la cible confirmé dans une lignée cellulaire de mammifère par cytométrie en flux et PLA. Pas un modèle, une mesure.
Séquences en FASTA, modèle du complexe ternaire en PDB, données brutes et analysées, notes d’expression et de stabilité, et la justification écrite de l’épitope retenu. Le tout dans votre portail sécurisé.
De 12 à 15 semaines entre la demande et la livraison, avec un cahier de conception concret entre vos mains dès la première semaine. Voir les quatre étapes.
La première conversation précède toute entente de confidentialité et demeure non confidentielle. Demandez-la et une entente mutuelle vous revient dans un délai de deux jours ouvrables, avant tout échange de structure ou de séquence.
Apportez une cible et le résultat souhaité. En 30 minutes, vous repartez avec la voie que nous emprunterions, les essais qui la démontreraient et l’échéancier. Si un liant protéique n’est pas le bon outil pour votre cible, nous vous le dirons pendant l’appel.
Vous préférez écrire ? Envoyez-nous plutôt votre cible. Dans les deux cas, ce que vous recevez ensuite, c’est une voie, pas une soumission.
Une démarche intégrée de conception de modulateurs, d’ingénierie des protéines et de validation cellulaire.
Présentez votre cible, sa biologie et le mécanisme de modulation souhaité, sans frais ni obligation. Vous recevez un cahier de conception concret dans la semaine.
Nous concevons et classons par ordinateur des candidats modulateurs contre l’interface de votre cible. Les modulateurs sont prêts pour la validation cellulaire.
Nous réalisons des essais fonctionnels de liaison ou de dégradation dans des lignées cellulaires physiologiquement pertinentes.
Consultez l’ensemble de votre dossier de données dans notre portail sécurisé : séquences, modèles structuraux, résultats de validation cellulaire et documentation d’ingénierie.
Commencez par une description non confidentielle de la cible et l’objectif du programme, sans frais ni obligation.
Évaluer ma cible
Opérations de laboratoire intégrées à l’IRCM, à Montréal.
Priorisation expérimentale des candidats conçus par ordinateur.
Confirme l’activité d’inhibition ou de dégradation directement en cellules.
Chaque programme fait l’objet d’un prix fixe pour la cible, convenu par écrit avant le début des travaux : il n’y a donc pas de facturation horaire ouverte. Le montant dépend de la voie retenue (inhibition ou dégradation), du nombre de liants que vous souhaitez mener jusqu’à la validation et des essais nécessaires pour démontrer le résultat. Vous recevez cette soumission après l’appel de cadrage, pas avant que nous comprenions la cible.
Une CRO exécute le protocole que vous lui remettez. Ici, la partie difficile consiste à décider quelle surface engager et quelle géométrie fonctionnera, et c’est précisément ce que nous faisons et documentons. Faire ce travail à l’interne suppose de bâtir une plateforme de conception générative et un laboratoire capable d’en valider les résultats, puis de garder les deux occupés. Chez nous, les deux sont déjà jumelés : les conceptions sont générées par ordinateur et confirmées en cellules dans notre propre laboratoire à l’IRCM, et vous engagez un programme à la fois.
Trois cas. Si vous avez besoin d’une petite molécule administrable par voie orale en clinique, un liant protéique n’est pas le bon format. S’il n’existe ni structure expérimentale ni modèle prédit fiable de votre cible, nous n’avons encore rien contre quoi concevoir. Et si votre cible est extracellulaire et qu’un anticorps de catalogue fait déjà le travail, achetez l’anticorps. Nous vous dirons lequel de ces cas s’applique pendant l’appel, plutôt qu’après un bon de commande.
Un nom ou une classe de cible non confidentiels, le résultat biologique souhaité et toute contrainte à respecter dans la conception (préférence de ligase E3, lignée cellulaire, format de livraison). Aucune séquence ni coordonnée à cette étape.
Les cibles protéiques intracellulaires et extracellulaires pour lesquelles il existe une structure ou un modèle prédit fiable.
La ou les séquences de liants en FASTA, un modèle structural du complexe ternaire prédit (PDB), les données de validation brutes et analysées, des notes d’expression et de stabilité, ainsi qu’une justification écrite de l’ingénierie pour l’épitope et la géométrie retenus. Les données sont entièrement accessibles dans notre portail sécurisé, où vous pouvez visualiser vos complexes protéiques et télécharger les fichiers.
Le formulaire initial précède toute entente de confidentialité. Demandez une entente dans le formulaire et nous vous retournons une entente mutuelle dans un délai de deux jours ouvrables, avant tout partage de structure ou de séquence.
Posez-la pendant l’appel de cadrage. Trente minutes, avant toute entente de confidentialité, et vous repartez avec une voie pour votre cible, que vous travailliez avec nous ou non.
Évaluation gratuite de votre cibleVous préférez écrire ? Envoyez-nous plutôt un message.
Réservez un appel de cadrage de 30 minutes pour discuter de votre cible, de votre stratégie E3 et de la bonne voie d’ingénierie.
Prendre rendez-vousOuvre Google Agenda · 30 min · Sans entente de confidentialité
