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Preuves / Étude de cas 01 · CDC20
Étude de cas 01 · CDC20 · Preuve de concept

Une fonction réduite au silence.
Une petite molécule
surpassée.

Un seul cycle de peptides de novo générés par IA contre l’interface du dégron D-box de CDC20 a plus que doublé la réponse de mort cellulaire de l’apcine dans des cellules HeLa. Mort cellulaire mesurée par FACS.

Cible
CDC20 · D-box
Modalité
Peptide de novo
Modèle
Cellules HeLa
Lecture
FACS · N=3
2,7×
Dose plus faible, même effet
FACS · HeLa
1
Cycle de conception
Aucune optimisation itérative
9
Acides aminés
Conçu de novo
Figure 1 · Lecture principale

Mort cellulaire dans des cellules HeLa, selon la dose

% de mort cellulaire · FACS · N=3

Doses en µM. La ligne pointillée marque la réponse la plus élevée de l’apcine aux doses testées (21 % à 300 µM).
L’étude
01

Le défi

CDC20 est une cible en oncologie. Sa fonction est contrôlée par la D-box, une petite interface protéine-protéine en forme de sillon. Les petites molécules s’y lient avec une affinité moyenne, mais elles sont trop petites pour empêcher efficacement les motifs peptidiques naturels de s’y fixer. L’apcine, l’inhibiteur de référence, montre une activité faible même à fortes doses.

02

L’approche

Avec sa plateforme de novo, ProxAI a conçu des peptides de 9 acides aminés pour se lier à la D-box de CDC20. Les candidats ont été évalués par ordinateur, puis sont passés directement à un essai cellulaire. Un seul cycle de conception. Aucune itération.

03

Le résultat

Le peptide principal, PRX-01, a induit 56 % de mort cellulaire dans des cellules HeLa, soit 9,3 fois plus que le contrôle négatif à 6 % et plus du double de la réponse de l’apcine à doses équivalentes. Il a égalé l’effet de mort cellulaire de l’apcine à une concentration 2,7 fois plus faible.

Méthodes et réserves

Lecture : pourcentage de mort cellulaire par cytométrie en flux (FACS) dans des cellules HeLa, N=3. Les rapports sont calculés à partir de cette lecture : 9,3× correspond à PRX-01 (56 %) par rapport au contrôle négatif (6 %); la comparaison de puissance reflète la concentration nécessaire pour atteindre un effet de mort cellulaire comparable à celui de l’apcine. Les résultats proviennent d’un seul cycle de conception non optimisé et constituent une preuve de concept, et non un produit thérapeutique validé. Les valeurs absolues dépendent des conditions de l’essai et de la dose. Les affirmations de cette page reposent sur des données internes et demeurent sujettes à une revue scientifique.

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